Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms