Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB9

AURKC, Aurora kinase C, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKCQ9UQB9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AURKCQ9UQB9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AURKCQ9UQB9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms