Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TNRC6BQ9UPQ9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms