Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
AGAP1Q9UPQ3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms