Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNX7Q9UNH6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms