Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMX5

NENF, Neudesin, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENFQ9UMX5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NENFQ9UMX5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NENFQ9UMX5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NENFQ9UMX5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NENFQ9UMX5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms