Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DENND2AQ9ULE3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms