Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms