Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU7

ACAD8, Isobutyryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD8Q9UKU7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ACAD8Q9UKU7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACAD8Q9UKU7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACAD8Q9UKU7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACAD8Q9UKU7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ACAD8Q9UKU7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACAD8Q9UKU7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACAD8Q9UKU7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACAD8Q9UKU7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACAD8Q9UKU7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ACAD8Q9UKU7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACAD8Q9UKU7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACAD8Q9UKU7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACAD8Q9UKU7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACAD8Q9UKU7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACAD8Q9UKU7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACAD8Q9UKU7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms