Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms