Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C4Q9UKN8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms