Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRTO4Q9UKD2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRTO4Q9UKD2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRTO4Q9UKD2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRTO4Q9UKD2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRTO4Q9UKD2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRTO4Q9UKD2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRTO4Q9UKD2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRTO4Q9UKD2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRTO4Q9UKD2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRTO4Q9UKD2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRTO4Q9UKD2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MRTO4Q9UKD2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRTO4Q9UKD2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRTO4Q9UKD2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRTO4Q9UKD2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRTO4Q9UKD2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRTO4Q9UKD2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRTO4Q9UKD2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRTO4Q9UKD2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MRTO4Q9UKD2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms