Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CCNL1Q9UK58 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms