Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA2Q9UJY4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms