Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SIX4Q9UIU6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms