Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF639Q9UID6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF639Q9UID6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 278 ms