Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX20Q9UHI6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms