Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1NQ9UHG2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms