Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
AFF4Q9UHB7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFF4Q9UHB7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms