Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DBF4Q9UBU7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DBF4Q9UBU7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DBF4Q9UBU7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms