Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
POLKQ9UBT6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms