Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXTL2Q9UBQ6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXTL2Q9UBQ6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXTL2Q9UBQ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXTL2Q9UBQ6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXTL2Q9UBQ6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXTL2Q9UBQ6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXTL2Q9UBQ6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
EXTL2Q9UBQ6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXTL2Q9UBQ6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXTL2Q9UBQ6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXTL2Q9UBQ6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXTL2Q9UBQ6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXTL2Q9UBQ6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXTL2Q9UBQ6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXTL2Q9UBQ6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXTL2Q9UBQ6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms