Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GALPQ9UBC7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GALPQ9UBC7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GALPQ9UBC7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GALPQ9UBC7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GALPQ9UBC7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GALPQ9UBC7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GALPQ9UBC7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GALPQ9UBC7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GALPQ9UBC7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GALPQ9UBC7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GALPQ9UBC7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GALPQ9UBC7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GALPQ9UBC7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GALPQ9UBC7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GALPQ9UBC7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms