Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3BQ9UBC3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms