Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IGSF9Q9P2J2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9Q9P2J2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms