Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPZ2Q9P299 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms