Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXXC1Q9P0U4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms