Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TMOD2Q9NZR1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD2Q9NZR1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms