Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARHGEF12Q9NZN5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms