Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms