Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms