Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COMMD8Q9NX08 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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