Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms