Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms