Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFT57Q9NWB7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms