Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AP5S1Q9NUS5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms