Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCF3Q9NUQ8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms