Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CISHQ9NSE2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CISHQ9NSE2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms