Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS26

SPANXA1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome A, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXA1Q9NS26 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPANXA1Q9NS26 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXA1Q9NS26 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms