Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNNM1Q9NRU3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms