Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX15Q9NRS6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms