Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 28.9
DROSHAQ9NRR4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.423e-8■■■■■ 28.9
DROSHAQ9NRR4 ERF-206ENST00000596818 566 ntTSL 326.07■■□□□ 1.762e-7■■■■■ 28.8
DROSHAQ9NRR4 CAPN15-207ENST00000568988 911 ntTSL 341.83■■■■■ 4.292e-6■■■■■ 28.8
DROSHAQ9NRR4 CAPN15-202ENST00000562370 942 ntTSL 241.83■■■■■ 4.292e-6■■■■■ 28.8
DROSHAQ9NRR4 FARSA-203ENST00000586146 1707 ntTSL 533.57■■■□□ 2.961e-10■■■■■ 28.8
DROSHAQ9NRR4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.671e-10■■■■■ 28.8
DROSHAQ9NRR4 FARSA-208ENST00000588965 1831 ntTSL 529.8■■■□□ 2.361e-10■■■■■ 28.8
DROSHAQ9NRR4 FARSA-209ENST00000592662 864 ntTSL 1 (best)29.51■■■□□ 2.311e-10■■■■■ 28.8
DROSHAQ9NRR4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.241e-10■■■■■ 28.8
DROSHAQ9NRR4 FARSA-210ENST00000593021 1135 ntTSL 529.03■■■□□ 2.241e-10■■■■■ 28.8
DROSHAQ9NRR4 FARSA-206ENST00000587981 521 ntTSL 228.55■■■□□ 2.161e-10■■■■■ 28.8
DROSHAQ9NRR4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.091e-10■■■■■ 28.8
DROSHAQ9NRR4 SDHB-203ENST00000466613 828 ntTSL 225.61■■□□□ 1.692e-7■■■■■ 28.8
DROSHAQ9NRR4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.432e-7■■■■■ 28.8
DROSHAQ9NRR4 FARSA-204ENST00000586280 803 ntTSL 319.52■□□□□ 0.721e-10■■■■■ 28.8
DROSHAQ9NRR4 SDHB-207ENST00000485515 699 ntTSL 519.25■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 28.8
DROSHAQ9NRR4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.119e-7■■■■■ 28.8
DROSHAQ9NRR4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.939e-7■■■■■ 28.8
DROSHAQ9NRR4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.459e-7■■■■■ 28.8
DROSHAQ9NRR4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.889e-7■■■■■ 28.8
DROSHAQ9NRR4 C1orf159-207ENST00000434641 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 527.44■■□□□ 1.981e-9■■■■■ 28.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf159-212ENST00000467751 2099 ntTSL 227.29■■□□□ 1.961e-9■■■■■ 28.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf159-218ENST00000482816 982 ntTSL 526.91■■□□□ 1.91e-9■■■■■ 28.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.891e-9■■■■■ 28.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.711e-9■■■■■ 28.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf159-203ENST00000379325 2010 ntTSL 224.79■■□□□ 1.561e-9■■■■■ 28.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf159-215ENST00000475119 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 323.8■■□□□ 1.41e-9■■■■■ 28.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf159-209ENST00000462097 836 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.92■■□□□ 1.261e-9■■■■■ 28.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf159-216ENST00000477196 3214 ntTSL 218.98■□□□□ 0.631e-9■■■■■ 28.7
DROSHAQ9NRR4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.553e-6■■■■■ 28.7
DROSHAQ9NRR4 TAF4-207ENST00000608887 284 ntTSL 416.18■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 28.7
DROSHAQ9NRR4 APBA2-210ENST00000559814 2555 ntTSL 1 (best)26.32■■□□□ 1.82e-7■■■■■ 28.7
DROSHAQ9NRR4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.493e-6■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 COL27A1-207ENST00000494090 5329 ntTSL 1 (best)23.12■■□□□ 1.291e-7■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 COL27A1-202ENST00000451716 2865 ntTSL 1 (best)17.49■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.352e-6■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.322e-6■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.062e-6■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 BCOR-206ENST00000406200 4216 ntTSL 212.23□□□□□ -0.455e-7■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.545e-7■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.725e-7■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.221e-6■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-208ENST00000490359 540 ntTSL 225.65■■□□□ 1.77e-42■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 MPZL1-205ENST00000448405 1596 ntTSL 1 (best)35.67■■■■□ 3.32e-9■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.592e-9■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.472e-9■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.962e-9■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 MPZL1-202ENST00000367853 881 ntTSL 1 (best)12.61□□□□□ -0.392e-9■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 MPZL1-208ENST00000474729 1335 ntTSL 1 (best)11□□□□□ -0.652e-9■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 MPZL1-204ENST00000403379 961 ntTSL 58.77□□□□□ -1.012e-9■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.691e-9■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.462e-7■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 NUBP2-211ENST00000567700 2196 ntTSL 230.4■■■□□ 2.462e-7■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.441e-9■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 NUBP2-207ENST00000565603 995 ntTSL 329.89■■■□□ 2.372e-7■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 NUBP2-215ENST00000568834 1173 ntTSL 229.8■■■□□ 2.362e-7■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.292e-7■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 NUBP2-202ENST00000562263 811 ntTSL 327.96■■■□□ 2.072e-7■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 NUBP2-216ENST00000569898 582 ntTSL 327.68■■■□□ 2.022e-7■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.92e-7■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.542e-7■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 SDHAF3-204ENST00000489852 360 ntTSL 324.58■■□□□ 1.531e-9■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.841e-9■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 GAS6-205ENST00000610073 2169 ntTSL 229.34■■■□□ 2.292e-6■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.424e-7■■■■■ 28.5
DROSHAQ9NRR4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.364e-7■■■■■ 28.5
DROSHAQ9NRR4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.364e-7■■■■■ 28.5
DROSHAQ9NRR4 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.814e-7■■■■■ 28.5
DROSHAQ9NRR4 B9D1-213ENST00000575403 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.514e-7■■■■■ 28.5
DROSHAQ9NRR4 B9D1-204ENST00000395616 733 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.54e-7■■■■■ 28.5
DROSHAQ9NRR4 B9D1-214ENST00000575478 553 ntTSL 217.77■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 28.5
DROSHAQ9NRR4 DCXR-221ENST00000585164 475 ntTSL 533.29■■■□□ 2.922e-6■■■■■ 28.5
DROSHAQ9NRR4 DCXR-209ENST00000579155 430 ntTSL 528.31■■■□□ 2.122e-6■■■■■ 28.5
DROSHAQ9NRR4 DCXR-204ENST00000577712 429 ntTSL 525.79■■□□□ 1.722e-6■■■■■ 28.5
DROSHAQ9NRR4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.075e-7■■■■■ 28.5
DROSHAQ9NRR4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.715e-7■■■■■ 28.5
DROSHAQ9NRR4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.615e-7■■■■■ 28.5
DROSHAQ9NRR4 ARFRP1-211ENST00000618568 1612 ntTSL 331.44■■■□□ 2.622e-6■■■■■ 28.5
DROSHAQ9NRR4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.092e-6■■■■■ 28.5
DROSHAQ9NRR4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.762e-6■■■■■ 28.5
DROSHAQ9NRR4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 28.4
DROSHAQ9NRR4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.941e-7■■■■■ 28.4
DROSHAQ9NRR4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.941e-7■■■■■ 28.4
DROSHAQ9NRR4 MYL6-204ENST00000546630 544 ntTSL 1 (best)22.34■■□□□ 1.171e-7■■■■■ 28.4
DROSHAQ9NRR4 MYL6-212ENST00000548725 582 ntTSL 219.58■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 28.4
DROSHAQ9NRR4 MYL6-208ENST00000547703 675 ntTSL 518.87■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 28.4
DROSHAQ9NRR4 MYL6-217ENST00000550639 419 ntTSL 514.44□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 28.4
DROSHAQ9NRR4 MYL6-214ENST00000549392 411 ntTSL 514.22□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 28.4
DROSHAQ9NRR4 MYL6B-203ENST00000548571 223 ntTSL 413.55□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 28.4
DROSHAQ9NRR4 MYL6-221ENST00000552297 454 ntTSL 310.64□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 28.4
DROSHAQ9NRR4 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 28.4
DROSHAQ9NRR4 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.791e-6■■■■■ 28.4
DROSHAQ9NRR4 LAMA5-213ENST00000497053 723 ntTSL 322.68■■□□□ 1.229e-7■■■■■ 28.4
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.511e-7■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.291e-7■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.171e-7■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-215ENST00000450019 1689 ntTSL 534.4■■■■□ 3.11e-7■■■■■ 28.3
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