Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms