Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO6Q9NRD1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO6Q9NRD1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO6Q9NRD1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO6Q9NRD1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO6Q9NRD1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO6Q9NRD1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO6Q9NRD1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO6Q9NRD1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO6Q9NRD1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO6Q9NRD1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO6Q9NRD1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO6Q9NRD1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO6Q9NRD1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO6Q9NRD1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO6Q9NRD1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO6Q9NRD1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO6Q9NRD1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO6Q9NRD1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO6Q9NRD1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms