Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDF3Q9NR23 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms