Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BIN3Q9NQY0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms