Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM10Q9NQV6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms