Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms