Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms