Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms